Jede Behandlung wird nach einem bestimmten Plan, dem Behandlungsprotokoll, durchgeführt. Dieser Plan sieht genau vor, wann welches Medikament verabreicht werden muss, wann jeweils ein Spitalsaufenthalt oder eine Kontrolluntersuchung notwendig ist, wie oft und wann eine Punktion gemacht werden muss und wann die Therapie zu Ende ist.

Zu Beginn der Behandlung ist meist ein kurzer Spitalsaufenthalt notwendig. Es werden dabei noch verschiedenste Untersuchungen durchgeführt und genau geprüft, ob die Leukämiezellen auf die Behandlung überhaupt reagieren.